它们的多种生物学作用,蛋白质可以反映正在进行的RA疾病过程,并可能提供反应的生物标志物。但是,研究蛋白质分离可能会导致将原因与炎症的结果分开的挑战。如果蛋白水平在遗传控制下,则可以鉴定出潜在的,稳定的治疗前遗传生物标志物。目标:确定用依那耐等治疗的RA患者中是否存在遗传基础蛋白表达。方法:参与者是从英国的一项前瞻性多中心研究中招募的,该研究符合1987年ACR或2010年ACR/Eular/Eular/Eular分类标准RA的标准,从Etanercept开始是第一个生物学。使用所有理论片段离子光谱质谱法(SWATH-MS)的顺序窗口采集进行定量蛋白质组学。基因分型,并使用Genomestudio软件(Illumina,Illumina,Illumina,San Diego,CA,美国,美国)进行了基因型调用。在标准遗传QC和插补后,使用针对稳定的混杂协变量(年龄,生物学性别,疾病持续时间,同时使用DMARD使用,血清阳性状态)进行调整的线性模型进行了蛋白质定量性状基因座(PQTL)分析。为CIS PQTL设置了P <1E-05的暗示意义水平;由于样本量适中,不考虑反式PQTL。显着性阈值已根据虚假发现率进行调整,因此,p <0.05的任何调整结果都被认为是显着的。PQTL。结果:招募了147名参与者,中位年龄为56.39岁[IQR 49.34-64.73],中位疾病持续时间为6年[IQR 2-13],其中108(75.52%)为女性。482独特的蛋白质可用于蛋白质组学和遗传学数据QC后分析。基线(预处理),为60种蛋白质鉴定了2,184个顺式PQTL(这可能反映了强烈的链接不平衡中的许多PQTL)。治疗3个月后,为68种蛋白质鉴定了1,432个顺式PQTL。2蛋白具有PQTL(RS150571376,P ADJ = 3E-03和RS188695391,P ADJ = 1.07E-02),其中蛋白质表达在3个月时在3个月时也与DAS28相关(TCPH,P AXD = 1.40E-02和e-02和e Adj 6.40e-et = 6.40e-e = 54,结论:在RA患者中进行的PQTL分析鉴定了许多与配对蛋白表达数据显着相关的基因座。2基线蛋白TCPH和EHD1与处理后DAS28有关,并且具有其表达的遗传基础,并且这些蛋白质在ATP水解过程中都参与过程。参考:[1] Finckh等。Ann Rheum Dis 2006; 65(6):746-52。致谢:零。Disclosure of Interests: Stephanie Ling: None declared, Chuan Fu Yap: None declared, Nisha Nair: None declared, James Bluett Grant/research support from: Research grant from Pfizer, Ann Morgan: None declared, John Isaacs: None declared, Anthony G Wilson: None declared, Kimme Hyrich: None declared, Anne Barton: None declared, Darren Plant: None declared.doi:10.1136/annrheumdis-2023-Eular.6091
主要关键词