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芒果 ( Mangifera indica L.) 是全球种植和贸易最广泛的水果作物之一。芒果可以抵御季节性干旱期,尤其是在开花期间。然而,长期干旱胁迫会导致植物衰弱,并可能导致由非生物和生物因素引起的伤害和疾病。随着芒果基因组的公开,现在可以广泛开展与芒果干旱适应相关的基因组研究。在本研究中,使用“Alphonso”和“Tommy Atkins”品种(分别为 PRJNA487154 和 PRJNA450143)的全基因组序列 (WGS) 分析了芒果的全基因组干旱相关基因 (DRG)。使用 BLASTP,在“Alphonso”和“Tommy Atkins”的基因组中分别鉴定出 261 个和 257 个 DRG。这些基因中约 50% 与芒果对干旱的分子和生理适应有关。在干旱胁迫基因中,ABC 转运蛋白基因 ABCG40 在芒果中的同源物数量最多,其次是钙依赖性蛋白激酶基因 ZmCPK4 、 CPK21 和 CDPK7 ,以及质膜质子 ATPase OST2 。 DRG 的基因本体论 (GO) 分析表明,蛋白质结合、ATP 结合和 mRNA 结合是最常见的分子功能,而这些 DRG 的主要生物学过程与其对水分匮乏的反应有关。系统发育分析表明,“Alphonso”和“Tommy Atkins”中与干旱相关的蛋白质分别大致聚类为 7 个和 6 个主要分支。这项研究迄今为止提供了有关芒果全基因组 DRG 的最全面信息,可加强芒果和其他相关果树抗旱的标记辅助育种计划,以及未来结合有利等位基因来改善这种菲律宾重要水果作物的整体农艺特性。

“阿方索”干旱相关基因全基因组分析

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