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描述：该合作研究验证了一种用于检测番茄内源性参考基因 LAT52 的定性和定量 PCR 方法。每位参与者收到 12 个番茄基因组 DNA 样本，编号为 U1-U12，提取自具有不同地理和系统起源的番茄品种；10 个其他植物基因组 DNA，编号为 W1-W10，这些基因组 DNA 要么与番茄进化相关，要么是常用的植物材料；10 个 DNA 样本，编号为 S1-S10，是五个浓度水平的双盲重复，即番茄样品以 2%、0.5%、0.1%、0.05% 和 0.01% (w/w) 的比例与非转基因玉米粉混合而成；4 个纯化的番茄品种基因组 DNA 样本，编号为 AD；8 个盲 DNA 样本，编号为 X1-X8，包含四个番茄品种基因组 DNA 的两个浓度水平（0.5 和 0.05 ng/uL）。此外，参与者还收到一个由加分1号番茄DNA溶液组成的阳性DNA靶标对照和一个由鲑鱼精子DNA溶液组成的阴性DNA对照。此外，实验室还配备了定性PCR反应主混合物、定量PCR反应主混合物和DNA稀释溶液。使用编码为W1-W10的十种不同的DNA植物溶液验证了番茄LAT52基因的物种特异性。使用编码为U1-U12的12种不同番茄品种测试了番茄LAT52基因的等位基因变异。为了评估不同品种之间拷贝数的稳定性，参与者被要求使用来自编码为AD的四个番茄品种的基因组DNA稀释系列构建四个单独的标准曲线。为了评估LAT52定性PCR方法是否具有足够的灵敏度，实验室以连续稀释的浓度测试了编码为S1-S10的10个DNA样本。为了验证 LAT52 的定量 PCR 方法，每个实验室都使用了四个不同番茄品种（中薯 5、R144、早丰和林春）（分别编号为 A、B、C 和 D）的基因组 DNA，并将它们连续稀释至 50、5、0.5、0.05 和 0.01 ng 进行 PCR 反应，以构建四条标准曲线。然后使用 LAT52 实时 PCR 检测对这四个品种（编号为 X1-X8）的八个盲番茄样品进行定量。验证指标和描述性统计数据是根据每个级别进行三次重复的三次测试的数据计算得出的。
转基因方法 : QT-TAX-SL-002
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