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¥ 2.0
许多配体的灵活性使得这些计算变得困难，需要开发和使用特殊方法。以下两个例子说明了对此类工具的需求：蛋白酶抑制剂的设计和与特定 MHC 受体结合的肽抗原的分析和设计。我们回顾了从刚体对接扩展到柔性对接的计算概念，以及以下重要的柔性对接和设计策略：(a) 蒙特卡洛/分子动力学对接，(b) 现场组合搜索，(c) 配体构建，以及 (d) 位点映射和片段组装。讨论了使用经验自由能作为目标函数。由于方法学的快速发展，大多数新方法仅在有限数量的应用上进行了测试，并且可能会改进更传统的计算或图形工具获得的结果。
分子对接单元5：QSAR统计方法Dr.D....
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