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克利亚交换是对细菌菌株遗传操纵的最通用手段。通过这种方法，可以用选择性修饰的DNA序列代替细菌染色体或偶发组中的DNA段。因此，基因缺失，插入，基因融合，单基对更改等。可以在完全本地的情况下引入细菌基因组。为了简化这种经常使用的方法，FDA研究人员开发了一种改进，更快的技术，以将定义的遗传改变引入Bordetella物种的基因组，例如Bordetella tuspussis，Bordetella Parapertussis和Bordetella bronchiseptica。此方法使用综合载体的单个位点染色体DNA裂解来催化载体消除，从而导致等位基因替代。它可以用作研究特定基因在毒力中的重要性并创建具有理想特性（例如突变细菌毒素）的菌株的重要性（例如，百日咳毒素）不再具有毒性活性，而是完全免疫原性，或增加了疫苗成分的合成。
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