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摘要:使用CRISPR-CAS9核酸酶进行基因组编辑是基于DNA双重断裂(DSB)的修复。在真核细胞中,DSB通过同源指导的修复(HDR),非同源末端连接(NHEJ)或微学介导的终端连接(MMEJ)途径重新加入。其中,人们认为NHEJ途径是主导的,并且发生在整个细胞周期中。已知基于NHEJ的DSB维修是错误的;但是,很少有研究深入研究内源基因。在这里,我们通过掺入外源性DNA寡核苷酸来量化基于NHEJ的DSB修复精度(称为NHEJ精度)。通过对DSB发生后的外源性DNA和内源性靶点之间的连接序列的分析,我们确定NHEJ准确性的平均值在HEK 293T细胞中的最大值约为75%。在深入的分析中,我们发现NHEJ的精度依赖于序列,并且DSB端的近端邻近基序(PAM)的值相对较低,低于PAM远端的DSB。此外,我们观察到插入突变比与NHEJ准确性程度之间存在负相关。我们的发现将扩大对CAS9介导的基因组编辑的理解。

分析CRISPR介导的DNA裂解后基于NHEJ的DNA修复

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