Loading...
机构名称:
¥ 1.0

摘要红细胞侵袭阶段在恶性疟原虫中在繁殖,性测定和耐药性中起着关键作用。为了确定红细胞侵袭阶段中的关键基因和途径,使用了W2MEF菌株的基因集(GSE129949)和RNA-SEQ计数数据进行进一步分析。进行了一项综合生物启动研究研究,以审查基因作为潜在的药物靶标。487差异表达的基因(DEG)具有调整后的P值<0.001富含47个基因本体论(GO)项,这些术语基于超几何分析P值<0.01。蛋白质 - 蛋白质相互作用网络分析是使用具有较高置信度相互作用的DEG进行的(PPI评分阈值= 0.7)。MCODE和CYTOHUBBA应用程序用于定义轮毂蛋白,并根据多个拓扑分析和MCODE分数对它们进行排名。此外,通过使用MPMP数据库中的322个基因集进行基因集富集分析(GSEA)。通过领先分析确定了多个重要基因集中涉及的基因。我们的研究确定了编码蛋白质的六个基因,这些基因可能是与蛋白质侵袭阶段有关的潜在药物靶标,与MerozoITE的运动性,细胞周期调节,G依赖性蛋白激酶磷酸化,微蛋白蛋白的控制,微管组装的控制和性承诺有关。根据DCI(药物置信度指数)和预测结合口袋的值计算这些蛋白质的可药物性。表现出最好的结合袋值的蛋白质受到深度学习的虚拟筛选。该研究以抑制剂鉴定的蛋白质的药物结合评分来确定最佳的小分子抑制剂。

鉴定恶性疟原虫的红细胞侵袭途径中的潜在药物靶标

鉴定恶性疟原虫的红细胞侵袭途径中的潜在药物靶标PDF文件第1页

鉴定恶性疟原虫的红细胞侵袭途径中的潜在药物靶标PDF文件第2页

鉴定恶性疟原虫的红细胞侵袭途径中的潜在药物靶标PDF文件第3页

鉴定恶性疟原虫的红细胞侵袭途径中的潜在药物靶标PDF文件第4页

鉴定恶性疟原虫的红细胞侵袭途径中的潜在药物靶标PDF文件第5页

相关文件推荐