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表观遗传年龄预测因子是Horvath的表观遗传钟1,这是一个统计预测模型,在353 CpG位点使用DNAM至1个预测年龄。2种训练表观遗传时钟的标准方法涉及几个关键步骤:(i)从具有不同背景的个体3个个体的生物样本中收集生物样本; (ii)提取DNA并进行DNA甲基化分析; (iii)进行数据预处理4个程序,例如缺少数据插补,离群值删除和数据归一化; (iv)采用特征筛选方法5来识别相关的CPG站点,这些位点可预测年龄或与衰老过程相关; (v)将高维6回归模型与弹性净罚款拟合; (vi)在独立的测试数据集上评估模型性能,以验证其7个准确性和鲁棒性。8尽管有完善的构造表观遗传时钟的管道,但其中大多数仅提供点平均预测1,2,5。9

表观遗传时钟的不确定性定量通过共形分位数回归

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