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先天性心脏病 (CHD) 是造成大量发病率和死亡率的原因,但尽管心脏异常有影响,但其病因仍不太清楚。先前的证据表明遗传机制在 CHD 中发挥作用,最近的数据表明,参与胚胎发育的关键基因 NR2F2 在人类疾病中发挥作用。据推测,NR2F2 是参与心脏发生的分子网络的一部分,对它的研究可以阐明与心脏发育相关的 NR2F2 网络。先前未发表的数据显示,发育中的人类心脏的成纤维细胞和内皮细胞表达 NR2F2 mRNA。基因组编辑模型中的转录组分析使得能够研究基因表达模式和转录因子作为通路和基因组网络的调节剂。我们旨在通过在原代心脏成纤维细胞中敲除 NR2F2 的转录来研究其作用,并通过单细胞 RNA 测序进一步分析随之而来的整体转录组变化。我们从人类胎儿心脏样本中分离出原代迁移细胞,并通过流式细胞术和单细胞 RNA 测序对其进行了鉴定。我们还评估了这些细胞中 NR2F2 转录本和蛋白质的表达,然后针对 CRISPR/Cas9 优化了方案。我们使用核糖核蛋白 (RNP) 系统敲低了成纤维细胞中的 NR2F2,然后在敲低样本和对照样本中进行基于液滴的单细胞 RNA 测序,以比较 NR2F2 缺失引起的扰动。将生物信息学流程应用于类似的公开可用的心脏细胞数据集以进行比较。这些流程包括已知的用于基因表达分析的批量和单细胞 RNA 测序工具,包括 limma 和 Scanpy。因此,我们可以得出结论,人类胎儿成纤维细胞中 NR2F2 活性降低会干扰几种对心脏发生很重要的心脏基因表达,例如 GATA6 和 HEY1,并且还可能影响其他转录因子的活性,例如 NKX2-5,这些转录因子先前与 CHD 表型有关。

研究 NR2F2 在人类心脏发育过程中对成纤维细胞的作用

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