抽象的抗菌肽(AMP)被认为是抗抗生素时代中有希望的替代抗菌剂池。由于许多局限性,尤其是细胞毒性,将其实施限制在诊所中,因此寻找新型的无毒AMP具有很高的相关性。在本研究中,我们使用了多个逻辑回归来预测肽的抗菌和溶血能力。两个构造的模型表现出可接受的预测能力(在估计的最佳截止值,准确性,灵敏度,特异性,f-measure≥0.82,roc auc> 0.91)。进一步应用了抗菌活性预测的模型,以鉴定大蛋白序列中可能的AMP。该方法的验证是对来自不同结构类别的众所周知的AMP的前体进行的 - 人类嗜中性粒细胞肽1(HNP1),LL-37 Cathelicidin以及Tachyplesin I.在所有情况下,都正确预测了成熟的放大器定位,即在c-末端(HNP1,LL-37)或前体序列(tachyplesin I)的中间。该研究提供了一种易于解释的方法,用于预测抗菌和溶血肽及其在大蛋白中的鉴定。
主要关键词