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*这些作者对这项工作的贡献同样贡献:jingxuan he(juh709@psu.edu),ling-nan zou(lxz7@psu.edu)摘要我们描述了通过sp绘制的肽映射的肽映射,这是一个替代性c(sparc-map),一个方法可以识别两个互动互动的互动蛋白。我们的方法基于细菌宿主内的体内亲和力选择,并使用高吞吐量DNA测序结果来推断蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)接口的位置。SPARC-MAP仅使用常规微生物技术,而不依赖专门的仪器或重新建立蛋白质复合物的体外;它可以调节以检测PPI在广泛的亲和力上。它可以多路复用以并联探测多个PPI。它的非特异性背景可以精确测量,从而使PPI的敏感检测能够检测。使用SPARC-MAP,我们在(p21-PCNA复合物中恢复已知接口。我们还使用SPARC-MAP来探测嘌呤体,这是六种嘌呤生物合成酶的弱结合的复合物,在那里尚无PPI接口。在那里,我们确定满足底物渠道结构要求的接口;我们还确定了参与多种不同相互作用的蛋白质表面,我们使用现场人体细胞中特定于位点的光叠链链接来验证。最后,我们表明SPARC-MAP结果可以对基于机器学习的结构预测对输出施加严格的约束。

蛋白质 - 蛋白质相互作用界面的多重映射

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