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图1全尺度实验设计，以识别微生物教育的有益细菌。为了长期有益效果，建议在幼虫阶段进行微生物教育（A部分，绿色）。在幼虫饲养过程中要添加到海水中的微生物可以通过（1）由无病原体的无病原体供体牡蛎引入，这些牡蛎总是使用紫外线处理的海水保存在受控设施中，严格的生物安全性扎环和管理程序，或（2）通过仔细添加了基于培养的多型细菌细菌混合物，或（2）。必须优化混合物及其组成的方法，以最大程度地吸收幼虫的吸收（浸入或以冷冻干燥的形式，延迟或同时与饲喂生物群体形式延迟或同时）。曝光窗口（从胚胎发生到幼虫阶段），必须调整暴露于细菌鸡尾酒的持续时间。饲养条件是应测试的其他参数（温度，连续流或批处理系统）。多应变细菌混合物（B部分，橙色）的定义是更好地预测有益特性的必要上游步骤。首先，必须创建一个可耕种的细菌库。这些细菌将优先与宿主分离。抗病机构的动物（如果益生菌旨在提高对特定传染病的抗药性）必须从几个地理部位和不同季节收集，以最大程度地提高细菌多样性。这样获得的细菌将被培养，纯化和冷冻保存。可以测试几种用于细菌培养的物理化学参数（培养基，温度），以增加细菌文库中的潜在生物多样性。通过16S rRNA编码基因的Sanger测序来鉴定收集的每个培养菌株。并行，必须在计算机预测分析中进行预测，以预测哪种细菌通常与宿主中的耐药表型相关（如果益生菌旨在提高对特定传染病的抗性）。这项相关研究将有必要将几个（元）条形码分析先前是在从抗性和敏感动物到指定疾病的微生物群上产生的。这些相关分析，再加上对科学文献的详尽研究，应该使可以从收集中预测可能是有益的益生菌候选者的细菌。然后，必须测试微生物暴露的有益作用（C部分，灰色）。短期效应将在幼虫阶段进行测试。应特别注意多晶体细菌混合物对幼虫的生存和生理学的影响，以测试暴露是有害，有益还是对幼虫发育和生长特性是有害的，有益的还是中性的。用于分子分析的抽样（即转录组，条形码，代谢，表观基因组分析）可能值得对微生物效应的分子基础解密。最后，将在随后的生命周期阶段测试长期有益作用：少年和成年人将受到病原体的挑战。
海洋无脊椎动物疾病预防水产养殖的微生物教育
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