人的大脑是复杂的神经生物学系统的核心,其中神经元,电路和子系统在策划行为和认知方面进行了研究。神经科学的最新研究表明,大脑区域之间的相互作用是神经发育和疾病分析的关键驱动因素[1,2]。使用结构或功能连通性映射人脑的连接组已成为神经成像分析最普遍的范式之一。重新说,从地理深度学习中动机的图形神经网络(GNN)由于其建模复杂的网络数据建模而引起了广泛的兴趣。在文献中,功能和结构联系被广泛认为是用于大脑调查的有价值的信息资源[3]。但是,他们主要在特定的私人数据集上对其建议的模型进行实验。由于道德问题,通常无法公开使用的数据集,并且未披露成像预处理的详细信息,从而使其他研究人员无法重新调查实验。目前尚未进行有关如何设计有效GNN用于脑网络分析的系统研究。为了弥合这一差距,我们提出了BraingB,这是一种用于GNNS的大脑网络分析的基准,并于2023年在IEEE-TMI上发表[4]。1。我们在同类和模式的四个数据集上进行实验,并建议一组在大脑网络上进行有效GNN设计的食谱。基于这四个维度的不同组合作为基准,我们的贡献是四个方面:•建立了一个统一,模块化,可扩展和可重复的框架,用于使用GNN进行大脑网络分析,以实现可重复性。它旨在通过可访问的数据集,标准设置和基线来启用公平评估,以促进计算神经科学和其他相关社区中的协作环境。•我们总结了功能和结构性大脑网络的预处理和施工管道,以弥合神经影像学和ML社区之间的差距。•我们将基于GNN的大脑网络分析的感兴趣的设计空间分解为四个模块:(1)节点feapers,(b)消息通讯机制,(c)注意机制和(d)汇总策略。
主要关键词