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随着公共数据库中核基因组的增加,比较基因组学方法现在使用数百种基因组来分析物种多样性。许多研究着重于整个物种基因含量,即pangenome,以了解其在流行病学或环境数据方面的共同和可变基因方面的进化。在这种情况下,我们一直在研究基因组数据表示作为pangenome图。我们开发了用于重建和分配的pangenome重建和分区(Ppanggolin 1),基因组可塑性鉴定区域(PANRGP 2)和模块检测(PanModule 3)的方法。与Panorama一起,我们将实现新的方法论发展,以进行pangemenomes的比较研究。 将有助于研究细菌的适应潜力,并更好地了解微生物代谢多样性背后的进化动力学。与Panorama一起,我们将实现新的方法论发展,以进行pangemenomes的比较研究。将有助于研究细菌的适应潜力,并更好地了解微生物代谢多样性背后的进化动力学。

Panorama:探索种间多样性的微生物基因组的比较pangenomics工具

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