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下一代测序(NGS)技术的出现促进了临床诊断和个性化医学的范式转移,从而使能够访问高通量微生物组数据。然而,微生物组数据的固有高维,噪声和可变性给常规统计方法和机器学习技术带来了实质性障碍。即使是有希望的深度学习(DL)方法也不能免疫这些挑战。本文介绍了一种新型功能工程方法,该方法通过合并从输入数据派生的两个功能集来生成一个新数据集,从而规避这些限制,然后将其进行功能选择。这种创新方法明显增强了使用肠道微生物组数据中大肠癌(CRC)检测中深神经网络(DNN)算法下曲线(AUC)下的面积,从而将其从0.800升高到0.923。所提出的方法构成了该领域的显着进步,为微生物组数据分析的复杂性提供了强大的解决方案,并扩大了DL方法在疾病检测中的潜力。

革命性的结直肠癌检测

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