动机:元基因组数据集的计算机模拟中的准确性对于基准生物信息学工具以及实验设计至关重要。用户不仅取决于大规模的模拟,不仅是设计实验和新项目,而且还取决于项目中计算需求的准确估计。不幸的是,当前大多数读取模拟器都不适用于过时的宏基因组学,或者记录了相对较差。在本文中,我们描述了Inilicoseq,这是一个软件包,用于模拟宏基因组光明测序数据。Inilicoseq具有简单的命令行接口和广泛的文档。结果:iNilicoseq在Python中实现,能够以具有明智的默认参数的并行方式模拟现实的Illumina(Meta)基因组数据。可用性和实施:源代码和文档可在https://github.com/hadrieng/insilicoseq和https://insilicoseq.readthedocs.io/上获得。联系人:hadrien.gourle@slu.se补充信息:补充数据可从BioInformatics在线获得。
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