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摘要虽然对基因-增强子相互作用的调控进行了深入研究,但其应用仍然有限。在这里,我们重建了 CTCF 结合位点阵列,并设计了一种带有 tetO 的合成拓扑绝缘体用于染色质工程 (STITCH)。通过将 STITCH 与连接到 KRAB 结构域的 tetR 偶联以诱导异染色质并禁用绝缘,我们开发了一种药物诱导系统来控制增强子对基因的激活。在人类诱导多能干细胞中,插入 MYC 和增强子之间的 STITCH 下调了 MYC。STITCH 的进行性诱变导致基因-增强子相互作用的优先升级,证实了 STITCH 的强大绝缘能力。STITCH 还改变了 MYC 周围的表观遗传状态。通过药物诱导的时间过程分析发现,H3K27me3 抑制标记的沉积和去除跟随并反映表达变化,但不先于表达变化并决定表达变化。最后,插入 NEUROG2 附近的 STITCH 会削弱分化神经祖细胞中的基因激活。因此,STITCH 应该可以广泛应用于功能遗传学研究。

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