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在没有获批疫苗的情况下，开发有效的 SARS-CoV-2 抗病毒药物对于应对当前因 COVID-19 传播而导致的大流行性健康危机至关重要。由于任何传统的药物发现计划都是一个耗时且昂贵的过程，需要十多年才能完成，因此对现有药物进行计算机模拟再利用是快速选择有希望的临床候选药物的首选方法。在此，我们提出了一项虚拟筛选活动，以识别 SARS-CoV-2 木瓜蛋白酶样蛋白酶 (PLpro) 的共价和非共价抑制剂，这些抑制剂显示出对 COVID-19 治疗的潜在多靶点活性。从 ChEMBL（版本 27.1）下载了一个包含 688 种 III 期和 1702 种 IV 期临床试验药物的数据集，并将其对接到最近发布的 PLpro 与共价结合肽抑制剂复合物的晶体结构上。通过结合蛋白质-配体相互作用指纹相似性、常规对接分数和 MMGBSA 结合自由能对获得的结果进行分析，并确定了一些有趣的候选药物以进行进一步的体外测试。据我们所知，这项研究代表了首次尝试重新利用药物来共价抑制 PLpro，并可能为针对 COVID-19 的新治疗策略铺平道路。
将已知药物重新用于共价和非...
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