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许多植物物种的驯化和改良经常涉及转录输出的调节，并继续为靶向性状工程提供许多希望。然而，控制这些性状相关转录变体的顺式调控元件 (CRE) 位于非编码区内，目前大多数植物物种对这些区域的注释很少。这在大型作物基因组中尤其如此，因为调控区仅占整个基因组空间的一小部分。此外，人们对 CRE 如何调节植物转录的了解相对较少。因此，了解调控区在基因组中的位置、它们控制哪些基因以及它们的结构是可用于指导传统和合成植物育种工作的重要因素。在这里，我们描述了调控实例的经典示例以及植物调控基因组学的最新进展。我们重点介绍了有价值的分子工具，这些工具可以大规模识别 CRE，并提供有关基因如何在不同植物物种中受到调控的前所未有的见解。我们重点关注染色质环境、转录因子 (TF) 结合、转座因子的作用以及调控区域与靶基因之间的关联。
绘制植物中的调控决定因素图谱
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