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茄子是世界上最重要的蔬菜之一，有些品种有刺。这些刺出现在叶子、茎和果萼上，在栽培、收获和运输过程中带来挑战，使其成为一种不受欢迎的农艺性状。然而，人们对茄子刺形态发生的遗传机制仍知之甚少，这阻碍了遗传改良。在本研究中，遗传分析表明，刺形态发生由一个显性核基因控制，称为 PE（带刺茄子）。随后的批量分离子 RNA 测序 (BSR-seq) 和连锁分析初步将 PE 定位至 6 号染色体。然后该基因座被精细定位至 1109 株植物分离种群中 9233 bp 的间隔，仅含有一个候选基因 SmLOG1，它编码一种 LONELY GUY (LOG) 家族细胞分裂素生物合成酶。通过转录组和 qRT-PCR 进行的表达分析表明，SmLOG1 主要在未成熟的刺中表达。针对刺亲本系“PI 381159”中的 SmLOG1 进行的 CRISPR-Cas9 敲除实验消除了所有组织中的刺，证实了其在刺形态发生中的关键作用。SmLOG1 的序列分析仅在非编码区内精确定位了变异。我们从位于 SmLOG1 启动子内 − 735-bp 处的一个独特 SNP 开发了一个切割扩增多态性序列 (CAPS) 标记，发现与 190 个茄子种质中的刺变异有显著关联。这些发现增强了我们对控制茄子刺发育的分子机制的理解，并促进了使用标记辅助选择 (MAS) 培育无刺品种。
PE（刺茄子）编码一种细胞分裂素......
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