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随着合成生物学研究的规模越来越大,在活细胞中设计预定义功能需要越来越精确的工具。此外,遗传构建体表型性能的表征需要细致的测量和广泛的数据采集,以便在设计-构建-测试生命周期中为数学模型提供信息并匹配预测。在这里,我们开发了一种简化高通量转座子插入测序 (TnSeq) 的遗传工具:携带 Himar1 Mariner 转座酶系统的 pBLAM1-x 质粒载体。这些质粒源自 mini-Tn5 转座子载体 pBAMD1- 2,并按照标准欧洲载体结构 (SEVA) 格式的模块化标准构建。为了展示它们的功能,我们分析了 60 个土壤细菌 Pseudomonas putida KT2440 克隆的测序结果。新的 pBLAM1-x 工具已经包含在最新的 SEVA 数据库版本中,我们在这里使用实验室自动化工作流程描述了它的性能。

用于高通量筛选的标准化转座子工具

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