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出于发现药物的目的，AI用于基因组数据，以推断并确定导致疾病的特定突变的风险基因。这些风险基因被指定为出色的潜在治疗靶标。例如，可以将药物的作用建模为删除的基因，以及由于所讨论的基因缺失而导致的代谢途径，可以预测是评估药物作用的一种手段（Zampieri等人。2019）。监督的ML工具也被用来识别癌症驱动基因，这也可以用作潜在的新药靶标。无监督的ML方法可用于增强和补充药理学专家的知识，并识别可以作为候选者扩大已知药物的生物学作用的基因（A. P. Athreya等人（A. P. Athreya等）2018）。

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