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摘要我们计算研究Zika NS3解旋酶,这是一种使用ATP水解能进行核酸重塑的生物运动。通过经典和QM/MM模拟,我们探索了图案V的构象局势,该构象形象V连接了用于ATP水解和核酸结合的活性位点的保守环。由元磷酸组形成引发的ATP水解涉及由GLU286质子抽象激活的水分子的亲核攻击。基元V氢键通过Gly415骨干NH组与该水键合,从而有助于水解。当无机磷酸盐从镁离子的配位壳移开时,释放自由能,自由能被释放出来,从而诱导了基序V的构象构象构象构象构象形态的显着转移,以在Gly415 NH和Glu285之间建立氢键。Zika NS3解旋酶充当棘轮生物电动机,其基序V转变由Gly415的γ-磷酸在ATPase位点引导。

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