高通量遗传筛选经常用于与表型快速关联并建立序列功能关系。随着CRISPR技术的出现,可以使用合并的指南RNA(GRNA)库和基于测序的测定法对非模型生物进行功能询问以前的遗传性顽固生物,以定量评估并行的每个靶向轨迹。为了帮助构建合并的GRNA组件,我们使用GRNA序列区域提取工具(GRNA-Seqret)开发了用于GRNA选择的硅设计工作流。基于先前开发的CCTOP,GRNA-Seqret启用了针对用户规范区域的GRNA库的自动化,可扩展的设计,或任何原核生物或真核生物的整个基因组。此外,GRNA-Seqret相对于基因或其他特征的任何序列区域的批量提取自动化,有助于插入或缺失构建体的同源臂设计。我们还在计算机中评估了设计的GRNA文库在其他紧密相关的基因组中的应用,并证明对于密切相关的生物体,平均核苷酸同一性(ANI)> 95%> 95%的文库可能是相关的。可以通过https://grna.jgi.doe.gov访问GRNA-Seqret Web应用程序管道。源代码由免费的软件工具和自定义的Python脚本组成,可在https://bitbucket.org/ berkeleylab/grnadesigner/src/master/master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master/Master访问(https://bitbucket.orgelelab/grnadadadeciendiable of。
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