2019 冠状病毒病 (COVID-19) 大流行导致全球诊断检测用品短缺,尤其是在发展中国家。COVID-19 严重程度的危险因素包括既往合并症、高龄和男性,但其他变量也可能影响疾病结果。确实有越来越多的证据支持宿主遗传学在 COVID-19 结果的易感性中的作用。与 SARS-CoV-2 感染病程相关的遗传因素的识别依赖于 DNA 提取方法。本研究比较了使用患者鼻咽样本进行 COVID-19 宿主遗传研究的三种 DNA 提取方法(Chelex ® 100 树脂、苯酚-氯仿和 QIAamp DNA 提取试剂盒)。比较了这些方法的执行步骤数、样品处理时间、提取材料的质量和数量以及在遗传研究中的应用。我们发现 Chelex ® 100 方法最便宜(分别比商用试剂盒和苯酚-氯仿便宜 33 倍和 13 倍),DNA 产量最高(分别比商用试剂盒和苯酚-氯仿高 306 倍和 69 倍),处理步骤最少,同时为下游应用提供足够的 DNA 质量。总之,我们的结果表明 Chelex ® 100 树脂是一种廉价、安全、简单、快速且适合从 COVID-19 患者鼻咽样本中提取 DNA 以进行遗传学研究的方法。这在发展中国家尤其重要,因为成本和处理是材料加工的关键步骤。
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