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DNA是这个星球上所有生物的遗传物质,拥有生命的秘密。有机体中的DNA序列的完整集构成其基因组 - 该生物体的蓝图和说明手册,无论是人类还是人类[1]。因此,研究基因组的内容和含义的基因组学自出生以来一直站在科学研究的中心阶段。20世纪目睹了三个基因组学研究里程碑[1]。它始于发现门德尔的遗传定律[2],在DNA双螺旋结构[3]的揭示中引发了高潮[3],并以完成完整人类基因组序列的第一批草稿[4]结束。在新时代,随着高通量测序技术的进步和生物信息学方面的流动,已经累积了各种基因组的大量细节。因此,下一代基因组学的一个主要挑战是整合这些大量信息,并获得对基因组的一致全球视图[5]。为了应对这一挑战,已经采用了各种计算方法,包括深度学习是最新和最受欢迎的力量[6,7]。尽管列表中缺少是应用类别理论。类别理论是纯数学领域的新星。这是用于数学中不同领域之间思想的交流[8]。后来的人们发现,它是一种捕获某些主题的基本特征的语言和数学工具,并且可以一般应用[9]。本文的主要目标是解释为什么这是真的。类别理论已经成功地用于计算机科学,语言学和物理学[10]。实际上,应用类别已经发展成为一项全新的纪律本身,将领土扩展到社会科学,认知,神经科学,控制论等[11]。在本手稿中,我们建议应用类别理论是研究基因组学的强大而完美的工具。为了这样做,我们将首先介绍基因组学的历史,当前状态和下一个大问题。那么,我们将描述什么是类别理论和应用类别理论的当前发展,尤其是在生物学中。最后,我们试图桥接两个领域。使用频率基因组作为样本系统,我们证明了应用类别理论如何帮助我们更好地理解整个基因组。显然我们的最终目的是:揭示一般基因组的组织原则,在这项最初的工作中远非达到。但是,在手头正确的手臂和明确的方向下,我们要做的就是继续进行。如何命名本课程“分类基因组学” - 对G Insomics的c ate​​gory t Heory的研究?

基因组学应用类别理论

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