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靶向致病蛋白的治疗方式是多种疾病适应症的金标准。不幸的是,这些蛋白质中的很大一部分被标准的基于小分子的方法“不可能”,这在很大程度上是由于它们的无序性质和不稳定性。将功能性肽设计为不可用的靶标,无论是独立的粘合剂还是效应域的融合,因此为治疗干预提供了独特的机会。在这项工作中,我们将最新模型适应对比的语言图像预训练(剪辑),以设计一个统一的,基于序列的框架来设计目标特异性肽。此外,通过利用已知的实验结合蛋白作为支架,我们创建了一个流线型的推断管道,称为切割和夹子,有效地选择了肽进行下游筛选。最后,我们在实验中融合了候选肽与E3泛素连接酶结构域,并在人类细胞中证明了致病蛋白靶标的稳健细胞内降解,从而激发了我们技术的进一步发展,以促进未来的临床翻译。

通过对比深度学习设计基于肽的蛋白质降解器

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