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系统发生学是研究不同生物群体之间的进化关系。我们可能永远无法知道生命的真正起源，但您将在本单元中学习的分类方法是确定一组生物共同起源的重要工具。由于获得纯微生物培养物的限制，传统的通过研究形态特征来确定祖先层面的亲缘关系的方法并不总是适用于微生物。随着技术的进步，分子序列（DNA、RNA 和蛋白质）的可用性彻底改变了这些研究。人们认为这些序列就像“分子钟”，随着时间的推移而进化，保存了生存的关键信息。1965 年，Zuckerkandl 和 Pauling 首次提出了核酸和蛋白质序列随时间变化的概念，可以将其视为分子计时器。据推测，这些变化会随着时间的推移而增加，但本质上是中性的，因此蛋白质仍然具有功能性。如果两个生物群体中两个相似分子的序列完全不同，则意味着这两个群体很久以前就已经彼此分化了。因此，这些分子序列可以作为了解不同生物之间系统发育关系的丰富而可靠的信息来源。
微生物分类学中的表征
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