摘要微生物参与各种代谢相互作用。这些相互作用的一个关键部分是不同细胞器、细胞和环境之间的分子交换。介导这种代谢交换的主要力量是转运蛋白。这种转运很难通过实验测量，因为几种转运机制仍然不透明。然而，通过代谢交换对细胞输入和输出的理论计算使得我们能够成功推断出生物体内和生物体间系统的运作方式。动力学、代谢和统计建模方法与组学数据相结合，增强了我们对代谢交换和物质资源分配的认识和理解。这种模型驱动的分析方法可以指导有效的实验设计，并为生物功能和控制提供新的见解。