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摘要 在 2020 年 3 月 20 日宣布 COVID-19 大流行后的几个月内，世界各地开始检测到新的、传染性更强的 SARS-CoV-2 变体。由于国际旅行是疾病传播的主要原因，迅速识别进入一个国家的变体至关重要。在本研究中，我们利用基于废水的流行病学 (WBE) 来监测英国国际航空旅客入境 COVID-19 隔离设施产生的废水中变体的存在。具体来说，我们开发了多重逆转录定量 PCR (RT-qPCR) 检测方法，用于识别与 Beta (K417N)、Gamma (K417T)、Delta (156/157DEL) 和 Kappa (E154K) 变体相关的定义突变，这些变体在采样时（2021 年 4 月至 7 月）在全球流行。这些检测方法偶尔检测到与 Beta、Gamma 和 Kappa 变体相关的突变，占所有样本的 0.7%、2.3% 和 0.4%。在 13.3% 的样本中发现了 Delta 变体，峰值检测率和浓度在 2021 年 5 月 (24%) 达到峰值，与该变体在英国出现同时发生。RT-qPCR 结果与测序结果相关性良好，表明基于 PCR 的检测可以很好地预测变体的存在；尽管探针结合不充分可能导致假阳性或阴性结果。我们的研究结果表明，WBE 结合 RT-qPCR 可用作快速初步评估，以识别国际边界和大规模隔离设施中新出现的变体。
使用实时 RT-PCR 快速评估废水中的 SARS-CoV-2 变体相关突变
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