摘要基因治疗是通过破坏与疾病相关基因的表达或替换或纠正受影响细胞类型中突变的基因座的表达来治疗遗传性疾病,癌症或传染病。除了常规的基因转移方案外,设计器核酸酶(例如锌指核酸酶,故事核酸酶,巨核酸酶或CRISPR-CAS核酸酶)在该领域中越来越重要。使用设计师的核酸内切酶的使用使研究人员可以通过促进DNA双链断裂来校正有害突变。CRISPR-CAS技术被广泛用作强大的基因组编辑工具,因为它的简单性质由单个RNA分子引导到目标位点的核酸酶组成。尽管如此,主要问题之一是CRISPR-CAS系统的脱靶活动,该活动与特定的CRISPR-CAS核糖核蛋白(RNP)络合物针对基因组中其他序列的相似性有关。先前的研究表明,除了序列同源性外,靶向活性与细胞中的RNP浓度和基因组暴露于这些RNP的时间正相关。到目前为止,还没有执行很多测定,这些测定详细介绍了影响开目标和脱靶裂解动力学的参数。在我的主论文项目中,我开发了新颖的体外方法,以评估各种参数对靶向和脱靶裂解动力学和切割效率的影响。我的结果表明,CRISPR-CAS DNA裂解动力学在很大程度上取决于RNP,DNA靶位点和RNP脱靶结合位点的浓度。i发现,靶向裂解动力学和效率取决于(i)目标序列本身,(ii)RNPS和靶位点之间的比率,(iii)RNP的浓度,(iv),(iv)非目标裂解位点的浓度以及(v)(v)(v)off target结合位点的浓度。数据表明,单元格中的切割效率不仅取决于目标位点组成本身,而且还取决于脱靶裂解位点的数量,更重要的是 - 更重要的是 - 非目标结合位点的数量。
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