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抽象的粘着蛋白将基因组DNA挤压成促进染色质组装,基因调节和重组的环。在这里,我们表明粘着蛋白将负超胶引入挤出的DNA中。超螺旋需要粘蛋白的ATPase头,这些头部夹紧DNA以及在粘蛋白的铰链上的DNA结合位点,表明在铰链和夹具之间约束粘蛋白超侧Coil DNA。我们的结果表明,一旦粘蛋白在超涂层期间达到其失速扭矩,DNA挤出会停止,而粘蛋白突变体预测会停滞在较低的扭矩形成细胞中的较短环。这些结果表明,超涂层是环挤出机制的组成部分,并且粘着蛋白不仅通过循环DNA,而且通过将其超级旋转来控制基因组结构。真核间相细胞中的主要文本,SMC(“染色体的结构维持”)复合粘着蛋白将基因组DNA折叠成环和拓扑结构域(TADS;参考(1-4)),可以调节转录(5),重组(6,7),姐妹染色单体分离(8)和复制(9)。粘着蛋白通过由ATP结合 - 水溶液周期控制的构象变化(12)(在(13)中进行了综述),将DNA挤压为环(10,11)。这些是由粘蛋白的SMC1和SMC3亚基催化的,其中包含50 nm长的盘绕螺旋,二聚体“铰链”结构域和球形ATPase'heads'(图s1a),与ABC转运蛋白相关(14)。在ATP结合后,粘蛋白的头部接合和一个称为NIPBL“夹具” DNA的亚基在接合的ATPase头顶上(参考(12,15-17);如图。s1b)。这些动作产生〜15 pn力(18)和循环挤出步骤〜40 nm(100-200 bp;ref。(19)),表明在头部互动过程中将DNA卷入形成循环中。相比之下,在环挤出过程中DNA的构象变化知之甚少。拓扑异构酶II在粘着蛋白环的底部结合并切割DNA(20-23),这表明DNA在这些位点上是超螺旋的。有丝分裂SMC复合物冷凝蛋白还与拓扑异构酶(24-30)共定位并相互作用,并且可以在体外超涂DNA(31-33)。已经提出了此过程发生在循环挤出过程中(31,33),但发现粘着蛋白不适合

粘合素超元在循环挤出过程中DNA

粘合素超元在循环挤出过程中DNAPDF文件第1页

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