目标。这项研究的目的是使用16S rRNA基因的下一代测序(NGS)来表征并可能区分健康和肥胖马的下肠道(粪便)细菌。方法。这项研究涉及7匹马(4匹马和3匹母马),年龄8-17岁:乌克兰鞍品种1-4匹马(马1运动马匹rebus,10 Y.O.,马匹2马匹2种马santes,15 Y.O.,15 Y.O.,15 Y.O.),重量吃水的5匹马(种马Tsyhan,8 Y.O.)和非透明马6和7(Mare Sne-Zhynka,10 Y.O.,Mare Rumba 12 Y.O.)马匹2、4、5和7是肥胖,马1、3和6是健康的。所有马匹都保留在州生物技术大学的马术中心,乌克兰教育与科学部(乌克兰哈尔基夫)。根据制造商的说明,使用Purelink微生物组DNAPuriÞ阳离子试剂盒(Invitrogen,USA)提取直肠粪便样品的总DNA。准备了细菌16S rRNA的库,我们使用了16S rRNA条形码试剂盒1-24(美国牛津纳米波尔)。为了净化所获得的库,磁性颗粒核元素清理和尺寸选择(Macherey-Nagel,德国根据推荐的快速测序放大器的建议协议 - 16S条形码(SQK-16SS024)(测序套件的手册)。这些条件基于Fujiyoshi等人(2020)中所述的16S rRNA基因扩增阳离子的标准方案,并确保细菌DNA跨各种群分类群的稳健扩增。结果。结论。细菌门的代表(Syn.肌动杆菌),纤维杆菌,小叶虫 - 螺旋杆菌(Syn.螺旋体),杆菌,富公司(Syn.芽孢杆菌),planctomycetota,verrucomicrobiota(Syn.verrucomicrobia),念珠菌Melainabacteria,kiritimatiellota和proteeobacteria(Syn.假单胞菌)。占主导地位的门是坚硬的,其份额是所有检测到的门的50%至82%。与杆菌的数量相比,健康马匹和肥胖马之间的数量差异很大。在健康马1,3和6中,这是企业和肥胖的马2,4,5和7的2.5、3.4和2.9倍,它是8.6、8.2、7.6和5.7倍。与杆菌相比,坚硬的人数在健康马匹和肥胖马之间发生了显着变化。在健康的马1、3和6中,牢固的数量分别为2.5、3.4和2.9倍,而在肥胖的马2、4、5和7中,牢固的数量分别为8.6、8.2、7.6、7.6和5.7倍。在肥胖的马匹2、4、5和7中观察到蛋白杆菌的数量增加,范围为25%至37%,而在健康运动马1、3和6中,蛋白质的水平在1.07至3.43%之间,这对于健康动物的微生物组典型。在研究的马匹粪便中检测到低水平的放线菌(分杆菌):健康运动马3分别为0.09%,健康运动马3分别为0.09%,健康马匹6分别为0.15%。相比之下,肥胖的马2、4、5和7的水平分别从0.21%到0.48%。重要的是要注意,放线菌的门还包括BiÞ多杆菌属,在所研究的任何动物中均未检测到。在乌克兰第一次,我们对七个不同年龄,性别和品种的七匹马的下肠道(粪便材料)的细菌菌群进行了测序。在肥胖马的粪便中,细菌的细菌占主导地位(天细菌粉,粉状,裂缝),尤其是来自振荡性螺丝素和lachnospileceae的家族,并伴随着细菌的降低细菌(fcylumberimteroidota)(FC-fcbe)(FC-fc-
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