机构名称：
¥ 2.0
摘要 RNA 的结构变化是控制基因表达的重要因素，不仅在转录后阶段，而且在转录过程中也是如此。位于初级转录本 5' 区域的核糖开关和 RNA 温度计的子类通过提前终止转录来调节下游功能单元（通常是 ORF）。此类元素不仅自然存在，而且在合成生物学中也是颇具吸引力的装置。因此，设计此类核糖开关或 RNA 温度计的可能性具有相当大的实际意义。由于这些功能性 RNA 元素在转录过程中已经起作用，因此重要的是模拟和了解折叠的动力学，特别是与转录同时形成的中间结构。因此，在进行昂贵且劳动密集型的湿实验室实验之前，共转录折叠模拟是验证设计构造功能的重要步骤。对于 RNA，由于分子的大小和感兴趣的时间尺度，全面的分子动力学模拟远远超出了实际范围。即使在简化的二级结构级别，也需要进一步的近似。 BarMap 方法基于表示二级结构景观
评估共转录折叠模拟的质量
主要关键词
相关文件推荐
