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化疗耐药性在癌症死亡率中起着重要作用。为了确定影响对阿糖胞苷(AML 的主要治疗方法)敏感性的基因单元,我们基于双蛋白质编码和非编码集成 CRISPRa 筛选 (DICaS) 开发了一个全面的全基因组平台。最初使用来自 517 种人类泛癌细胞系的药物遗传学数据确定了假定的抗性基因。随后,通过 CRISPR 激活对编码和 lncRNA 基因进行了基因组规模的功能表征。对于 lncRNA 功能评估,我们开发了一种 CRISPR 激活 lncRNA (CaLR) 策略,针对 14,701 个 lncRNA 基因。计算和功能分析确定了新的细胞周期调控、存活/凋亡和癌症信号基因。此外,我们分析中确定的 GAS6-AS2 lncRNA 的转录激活导致 GAS6/TAM 通路过度激活,这是包括 AML 在内的多种癌症的耐药机制。因此,DICaS 代表了一种新颖而强大的方法,用于识别与治疗相关的综合编码和非编码途径。

一种集成的全基因组 CRISPRa 方法,用于功能化 IncRNA 的耐药性

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