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摘要：高通量药物发现高度依赖于可用的靶标，以加速候选药物的筛选过程。传统的化学蛋白质组学方法用于筛选药物靶标，通常需要固定/修饰药物分子以拉下相互作用的蛋白质。最近，基于能量学的蛋白质组学方法提供了一种研究药物 - 蛋白质相互作用的替代方法，即直接使用复杂的细胞裂解物，而无需对药物进行任何修饰。在本研究中，我们开发了一种新的基于能量学的蛋白质组学策略，即溶剂诱导蛋白质沉淀 (SIP) 方法，通过使用定量蛋白质组学来分析药物与其靶蛋白的相互作用。该方法适用于任何使用丙酮、乙醇和乙酸等常见化学试剂的实验室。SIP 方法能够识别细胞裂解物中众所周知的甲氨蝶呤、SNS-032 和星形孢菌素的泛激酶抑制剂的蛋白质靶标。我们进一步应用此方法发现格尔德霉素的靶标。成功鉴定了 HSP90 家族的三个已知蛋白质靶标，并首次鉴定了包括 NADH 脱氢酶亚基 NDUFV1 和 NDUFAB1 在内的几个潜在靶标，并使用蛋白质印迹法验证了 NDUFV1。此外，此方法能够评估药物 - 靶标相互作用的亲和力。这些数据共同证明我们的方法为药物靶标发现提供了一个强大的平台。
溶剂诱导蛋白质沉淀用于蛋白质组学规模的药物靶标发现
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