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经典的“小分子”药物研发方法主要关注小配体与酶、离子通道和受体等蛋白质之间的相互作用，因为这些蛋白质通常含有明确的配体结合位点，小分子可以与之相互作用[1,2]。该方法在很大程度上忽略了蛋白质-蛋白质相互作用（PPI），原因是小分子对PPI的调节具有挑战性[2-5]。相反，人们使用诸如免疫共沉淀、下拉分析、交联、标记转移、远Western印迹分析、核磁共振、X射线晶体学和大规模蛋白质组学等方法来表征PPI[6]。这种表征非常重要，因为PPI对蛋白质功能至关重要，并在生命过程中发挥着举足轻重的作用。毫不奇怪，它们会导致许多疾病，因为它们可能导致蛋白质复合物在本不应该聚集在一起或解体的时候聚集在一起或解体。事实上，异常的PPI与各种疾病有关，包括癌症、传染病和神经退行性疾病。然而，与球状蛋白与细胞内其他分子的相互作用相比，PPI更难在治疗上进行靶向治疗，因为一般来说，相互作用蛋白之间的界面 (i) 高度疏水性，大于通常的受体-配体接触面积[7]，(ii) 平坦，几乎没有用于设计抑制分子的凹槽，(iii) 具有以高亲和力相互结合的氨基酸残基，小分子很难抑制 [8]。尽管如此，靶向PPI越来越被视为开发治疗疾病的新药的一种有前途的策略[9,10]。最近，PPI 调节剂已经进入临床研究，其中一些已获批上市，这表明靶向PPI 的调节剂具有良好的前景（[2]及其中的参考文献）。
发现针对蛋白质的药物的挑战–...
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