最近爆发的 SARS-CoV-2 (2019-nCoV) 病毒凸显了快速有效疫苗开发的必要性。刺激导致保护的适当免疫反应高度依赖于通过 HLA 复合物向循环 T 细胞呈递表位。SARS-CoV-2 是一种大型 RNA 病毒,体外测试所有重叠肽以反卷积免疫反应是不可行的。因此,通常使用 HLA 结合预测工具来缩小要测试的肽的数量。我们测试了 19 种表位-HLA 结合预测工具,并使用体外肽 MHC 稳定性测定法,我们评估了 777 种预测为 11 种 MHC 同种异型良好结合剂的肽。在这项对潜在 SARS-CoV-2 表位的研究中,我们发现当前的预测工具在评估结合稳定性时的性能各不相同,并且它们高度依赖于所讨论的 MHC 同种异型。因此,设计一种仅包含少数表位靶标的 COVID-19 疫苗是一项非常具有挑战性的任务。在这里,我们展示了 174 个具有高预测结合分数的 SARS-CoV-2 表位,这些表位经验证可与 11 种 HLA 同种型稳定结合。我们的研究结果可能有助于设计一种有效的 COVID-19 疫苗。
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