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图 2:模型概述。所研究蛋白质的 PDB 文件用于生成其图形表示。然后,将 POI 和 E3 连接酶的这些图形表示传递到预先训练的 GearNet 进行特征提取,同时从 PROTAC 组件的 SMILES 中收集指纹。然后将各个特征连接起来,并将连接的向量传递到机器学习模型(XGBoost、随机森林或 MLP)以预测 PROTAC 的 DC 50 值。单个示例的多格式标签允许在回归和分类任务中训练所研究的模型。
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