机构名称：
¥ 1.0
RNA 分子在多种生物过程中起着至关重要的作用。深入了解它们的功能可以大大提高我们对生命机制的认识，并推动治疗各种疾病的药物的开发。最近，RNA 基础模型的进展为 RNA 工程带来了新方法，但现有方法在生成具有特定功能的新序列方面存在不足。在这里，我们介绍了 RNAGenesis，这是一个通过潜在扩散结合 RNA 序列理解和从头设计的基础模型。使用类似 Bert 的 Transformer 编码器（具有混合 N-Gram 标记化用于编码）、查询 Transformer（用于潜在空间压缩）和自回归解码器（用于序列生成），RNAGenesis 从学习到的表示中重建 RNA 序列。具体到生成，训练基于分数的去噪扩散模型来捕获 RNA 序列的潜在分布。 RNAGenesis 在 RNA 序列理解方面的表现优于当前方法，在 13 个基准测试中的 9 个中取得了最佳结果（尤其是在 RNA 结构预测方面），并且在设计类似天然的适体和具有理想特性的优化 CRISPR sgRNA 方面表现出色。我们的工作使 RNAGenesis 成为基于 RNA 的治疗和生物技术的强大工具。
RNAGenesis：增强 RNA 序列生成和结构洞察的基础模型
主要关键词
相关文件推荐
