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抽象数据机密性是数字时代的关键问题,影响了用户与公共服务之间以及科学计算组织与云与HPC提供商之间的互动。并行计算中的性能是必不可少的,但对于建立受信任的执行环境(TEE)以确保遥远环境中的隐私通常会对执行时间产生负面影响。本文旨在分析在英特尔SGX处理器机密的飞地内执行的DNA对齐(Bowtie2)的平行生物信息学工作负载的性能。结果提供了令人鼓舞的见解,内容涉及在大型数据集上使用基于SGX的TEE进行并行计算的可行性。调查结果表明,在高平行化条件下,并具有两倍的线程,在SGX飞地中执行的工作负载平均比非固定执行快15%。这种经验证明支持基于SGX的TEE有效平衡隐私需求与高性能计算的需求的潜力。

与Intel SGX多线程的DNA对齐工作负载的性能分析

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