摘要:基于废水的监视可以用作其他SARS-COV-2监视系统的补充方法。它允许在时间和地点监测感染和SARS-COV-2变体的出现和传播。这项研究提出了一种RT-DDPCR方法,该方法靶向SARS-COV-2基因组的尖峰蛋白中的T19i氨基酸突变,这是BA.2变体(Omicron)的特定的。T19i测定法在硅和体外评估了其包容性,敏感性和特定性。此外,从1月至2022年5月在布鲁塞尔 - 资本区域中,将废水样品用作监测和量化BA的出现的概念证明。硅分析中表明,使用T19I分析可以表征超过99%的Ba.2基因组。随后,成功评估了T19I分析的敏感性和特异性。得益于我们的特定方法设计,与整个SARS-COV-2相比,测量了T19I分析的突变探头和T19I分析的野生型探针的正信号,并且基因组的比例(BA.2突变体的特征)的比例是BA.2突变体的特征。评估了所提出的RT-DDPCR方法的适用性,以监视和量化BA.2变体的出现。为了证明该测定作为概念证明,与含有T19I突变的基因组的特定循环变体的比例相比,在20222年冬季和春季的Brussels-Papital区域的废水处理工厂的废水样本中进行了与总病毒种群相比。Ba.2基因组的出现和比例增加对应于使用呼吸样本监测中观察到的。但是,这种出现稍早地观察到,这表明废水采样可能是一个预警系统,并且可能是进行广泛人类测试的有趣替代方法。
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