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摘要:shot弹枪宏基因组测序用于研究切达干酪的微生物群落的多样性,在32个月内成熟。比较了从基于组装的,基于非组装和Motus2测序管道的分类单元丰度的变化,以描绘每个年龄段的社区预计。从58个样品中获得了11种通过质量阈值的元基因组组装基因组(MAG)。尽管cremoris lactocococcus cremoris和paracasei在shot弹枪样品中占主导地位,但使用MG-Rast鉴定了其他物种。NMDS对微生物群落的β多样性的分析揭示了年龄段(7个月至32个月)中奶酪的相似性。正如预期的那样,克雷莫氏乳糖菌的丰度因成熟而始终减少,而可渗透细胞的比例增加。在成熟时期,生存的乳酸酶杆菌的相对丰度逐渐增加,但在试验之间的速度可变。读取归因于siphoviridae和ascomycota的相对丰度低于1%。PMA处理的奶酪的功能性纤维与未经PMA处理的奶酪的功能不同。起动器旋转在乳球菌的单个核苷酸变体pro纤维中反射(使用motus2的SNV),而输入的牛奶是区分乳酸乳酸菌 / casei casei snv pro的领先因素。从Kraken2,非组装基于非组装的(MG-RAST)和标记基因簇(MOTUS2)的相对丰度估计值在两个主要分类单元的年龄组之间是一致的。宏基因组学启用了序列变体分析,低于细菌种类水平和功能性培养,可能会影响成熟过程中奶酪亚群之间的代谢相互作用,这可以帮助解释奶酪的整体膨胀。未来的工作将使微生物变体与挥发性释放物相结合,以将与奶酪粉的化合物的开发相关联,在每个成熟阶段。

使用斑马鱼研究多外观跳过作为啮齿动物的心肌病和心力衰竭的啮齿动物模型,用于翻译研究和治疗发现微生物

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