SARS-CoV-2 是一种正义单链 RNA 病毒,导致了 COVID-19 大流行。目前尚不清楚人类宿主细胞中的病毒是否以及在多大程度上经历了 RNA 编辑,这是一种主要的 RNA 修饰机制。在这里,我们对来自多个 COVID-19 患者支气管肺泡灌洗液样本的宏转录组数据进行了可靠的生物信息学分析,揭示了 SARS-CoV-2 中相当数量的 A-to-I RNA 编辑候选位点。我们通过评估 RNA 编辑特有的四个特征来确认这些候选位点上 A-to-I RNA 编辑信号的富集:推断的 RNA 编辑位点表现出 (i) 由基于 ADAR1 CLIP-seq 数据构建的深度学习模型预测的更强的 ADAR1 结合亲和力,(ii) ADAR1 抑制的人肺细胞中的编辑水平降低,(iii) 局部聚类模式,和 (iv) 更高的 RNA 二级结构倾向。我们的研究结果对于了解 SARS-CoV-2 的进化以及 COVID-19 研究(例如系统发育分析和疫苗开发)具有重要意义。