摘要 针对 COVID-19 和其他冠状病毒引起疾病的药物研究集中在最保守和最重要的蛋白质上,主要是主要蛋白酶 (M pro ) 和木瓜蛋白酶样 (PL pro ) 以及 RNA 依赖性 RNA 聚合酶 (RdRp)。M pro 的抑制剂 Nirmatrelvir 最近作为双药组合 Paxlovid 的一部分获得 FDA 批准,还有许多其他药物处于不同的开发阶段。多种 PL pro 抑制剂候选药物正在研究中,但尚未进入临床试验阶段。几种重新利用的 RdRp 抑制剂已投入使用。我们可以预期,一旦抗 COVID-19 药物得到广泛使用,就会出现 SARS-CoV-2 的耐药变体,我们已经看到针对 SARS-CoV-2 RdRp 的药物出现了这种情况。我们假设可以通过识别现有病毒种群中已经存在的可能的逃逸突变来预测此类变体的出现。我们小组之前开发了 coronavirus3D 服务器 (https://coronavirus3d.org),用于跟踪 SARS-CoV-2 在其蛋白质三维结构背景下的演变。在这里,我们引入了专门的页面来跟踪 M pro 和 PL pro 的潜在耐药突变的出现,表明此类突变已经在 SARS-CoV-2 病毒群中传播。通过定期更新,耐药性跟踪器提供了一种简单的方法来监测和潜在预测 SARS-CoV-2 病毒中耐药性突变的出现。
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