长度至少为 1 千碱基 (kb) 且重复序列同一性超过 90% 的 DNA 旁系同源物被归类为低拷贝重复 (LCR) 或片段重复 (SD)。它们占基因组的 6.6%,聚集在特定的基因组位点上。由于这些重复区域之间的序列同源性很高,它们可能在减数分裂期间错位,导致非等位基因同源重组 (NAHR),并导致结构变异,例如缺失、重复、倒位和易位。当此类重排导致临床表型时,它们被归类为基因组疾病。较大基因组片段的多个副本的存在为进化提供了机会。首先,人类谱系中新基因的产生将导致人类特有的特征和适应性。其次,人类群体之间的 LCR 变异可能导致表型变异。因此,与 LCR 相关的重排倾向应该在进化优势的背景下进行解释。