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为了理解生物在分子水平上的功能，我们需要知道表达哪些基因，何时何地在生物体中以及在哪个程度上。通过DNA，RNA，蛋白质和小分子之间的相互作用网络所结构的遗传调节系统来实现基因表达的调节。由于大多数遗传调节网络涉及通过互锁正面和负反馈回路相关的许多组件，因此很难获得对其染色体的直观理解。因此，对于遗传调节网络进行建模和模拟的形式方法和计算机工具是必不可少的。本文回顾了数学生物学和生物信息学用于描述遗传调节系统的形式主义，特别是有向图，贝叶斯网络，布尔网络及其概括，普通和部分差分方程，定性微分方程，定性差分方程，随机方程以及基于规则的形式主义。在适当的情况下，本文讨论了如何将这些形式主义用于模拟实际监管系统的行为。
遗传调节系统的建模和模拟
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