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总结系统生物学中的一个主要挑战是了解基因调节网络(GRN)中的各种基因如何共同执行其功能和控制网络动态。在具有数百个基因和边缘的大型网络的情况下,该任务变得极为难以解决,其中许多具有冗余的调节作用和功能。现有的模型减少方法通常需要对动态系统及其响应动力学参数的详细数学描述,而动力学系统通常不可用。在这里,我们提出了一种用于使用基于合奏的数学建模,降低维度降低和通过Markov Chain Monte Monte Carlo方法优化基因的数据驱动的大grn,名为Sacograci的粗粒度大GRN,称为Sacograci。sacograci需要网络拓扑作为唯一的输入,并且可以抵抗GRN中的错误。我们通过合成,基于文学和生物毒素的GRN进行基准并证明其用法。我们希望Sacograci能够增强我们建模复杂生物系统基因调节的能力。

用于粗粒基因调节网络的数据驱动优化方法。

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