小麦是全球粮食安全的重要贡献者,为了养活不断增长的人口,小麦需要进一步改良。功能遗传学和基因组学工具可以帮助我们了解不同基因的功能并设计有益的变化。在这项研究中,我们使用启动子捕获分析对四倍体小麦品种 Kronos 的 1,513 株诱变植物中所有高置信度注释基因上游 2 kb 区域进行测序。我们鉴定了 430 万个诱发突变,准确率为 99.8%,突变密度为每 kb 41.9 个突变。我们还将 Kronos 外显子组捕获读数重新映射到 Chinese Spring RefSeq v1.1,鉴定了 470 万个突变,并预测了它们对注释基因的影响。使用这些预测,我们鉴定出的非同义替换比原始研究多 59%,截断突变多 49%。为了展示启动子数据集的生物学价值,我们选择了 VRN - A1 春化基因启动子内的两个突变。这两个突变都位于转录因子结合位点内,显著改变了 VRN - A1 的表达,一个突变减少了每个穗的小穗数量。这些公开可用的测序突变数据集提供了快速且廉价的途径,可以获取大多数小麦基因启动子和编码区中诱导的变异。这些突变可用于了解和调节基因表达和表型,用于基础和商业应用,有限的政府监管可以促进部署。这些突变集合与基因编辑一起,为加速这种经济重要作物的功能遗传研究提供了宝贵的工具。
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