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胰腺癌是美国与癌症相关死亡的第三大主要原因。当前的治疗选择可提供惨淡的总体生存期,而5年生存期约为12%。对胰腺癌的临床和分子基础的分析对于开发早期检测方法以及新颖的治疗选择至关重要。这种疾病的侵略性和致命性需要开发用于胰腺癌数据的数据存储库和分析系统。胰腺癌动作网络(Pancan)Spark平台是由Velsera提供支持的基于云的数据和分析平台,它从Pancan研究计划中整合了现实世界中的患者健康数据,并通过使胰腺癌数据易于访问和使用来加速研究。涵盖了来自Pancan's New您的肿瘤®(KYT)精密医学服务中600多名胰腺癌患者的临床,成像和基因组学数据,Spark平台与癌症基因组学云(CGC)的公共可用癌症数据相连,也由Velsera驱动。CGC是NCI癌症研究数据共享(CRDC)的一部分,该数据共享(CRDC)是一种基于云的数据科学基础架构,该基础架构将数据与分析工具联系起来,以允许研究人员共享,集成,分析,可视化和推动科学发现。在这里,我们通过提供了一个案例研究来证明这些数据集的应用,该案例研究演示了如何结合和丰富数据以加速胰腺癌研究。目前,可在CRDC上获得的基因组和蛋白质组学数据分别为402例和304例胰腺肿瘤样品。我们将使用SPARK和CGC平台的功能,这些功能为不需要编码知识的多词分析提供了现成的工具。使用KYT和CRDC开放式胰腺癌数据,我们旨在演示如何对来自不同科学领域的数据进行综合分析,并与一个空间中的合作者共享,从而简化并增加了新科学发现的潜力。pancan和CGC数据集的进一步扩展无疑将为胰腺癌肿瘤生物学提供更全面的了解。SPARK和CGC基于云的计算基础架构,以及许多可用的癌症数据集以及易于使用的多派数据处理工作流程和数据分析工具将在此过程中发挥作用。

利用现实世界胰腺癌数据集推动药物发现和

利用现实世界胰腺癌数据集推动药物发现和PDF文件第1页

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